Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms