Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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