Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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UBE2Q1Q7Z7E8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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UBE2Q1Q7Z7E8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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