Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms