Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HECW1Q76N89 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms