Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
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