Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms