Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms