Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms