Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms