Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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