Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEX3CQ5U5Q3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms