Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms