Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms