Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms