Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIN4Q56A73 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN4Q56A73 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms