Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms