Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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