Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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