Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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EXT1Q16394 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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EXT1Q16394 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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EXT1Q16394 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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