Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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CNGA3Q16281 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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