Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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