Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms