Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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