Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CDSNQ15517 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CDSNQ15517 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CDSNQ15517 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CDSNQ15517 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CDSNQ15517 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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