Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PDCD1Q15116 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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PDCD1Q15116 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PDCD1Q15116 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PDCD1Q15116 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PDCD1Q15116 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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