Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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