Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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