Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms