Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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BECN1Q14457 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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BECN1Q14457 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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BECN1Q14457 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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BECN1Q14457 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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BECN1Q14457 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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BECN1Q14457 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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BECN1Q14457 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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