Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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