Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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