Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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