Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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