Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms