Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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