Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDRQ13258 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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