Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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