Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CBX3Q13185 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CBX3Q13185 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CBX3Q13185 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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