Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms