Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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KCNMA1Q12791 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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KCNMA1Q12791 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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KCNMA1Q12791 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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