Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms