Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms