Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms