Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA3Q08378 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms