Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms