Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms