Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms