Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms