Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms